Методика проведения ЗМУ утверждена Приказом Минприроды России от 11.01.2012 года №1. Учет проводится по заранее определенному учетному маршруту с одновременной записью параметров прохождения учетного маршрута на спутниковый навигатор. ЗМУ проводится в один (после пороши) или в два (с затиркой) дня, учитываются все следы зверей, оставленные ими в течение последних 20-28 часов и увиденные птицы. Протяженность одного учетного маршрута должна быть не менее 5 и не более 15 км. Всего запланировано провести учетные работы на 29 маршрутах общей протяженностью около 330 км.

После прохождения каждого учетного маршрута заполняется карточка учета ЗМУ с отметкой количества следов каждого вида зверей, пересекающих учетный маршрут и регистрацией увиденных охотничьих птиц. На распечатанном из спутникового навигатора треке наносятся условные обозначения пересечений следов зверей по группам категорий среды обитания (лес, поле, болото) и параметры прохождения учетного маршрута.

Данные по численности, полученные методом ЗМУ, используются при определении квот добычи соответствующих видов охотничьих ресурсов, норм допустимой добычи охотничьих ресурсов и норм пропускной способности охотничьих угодий и при осуществлении анализа состояния популяций охотничьих ресурсов.