История органов прокуратуры России началась с реформ Петра I. Своим указом от 12 января 1722 года он повелел "быть при Сенате генерал-прокурору и обер-прокурору, также во всякой коллегии по прокурору, которые должны рапортовать генерал-прокурору". Предназначение созданного органа Петр I определил относительно генерал-прокурора словами: "сей чин, яко око наше и стряпчий о делах государственных, того ради надлежит верно поступать, ибо перво на нем взыскано будет". Первым генерал-прокурором в России стал известный государственный деятель П.И. Ягужинский.
Военная прокуратура образовалась и организационно сформировалась в ходе судебной реформы 1864 г. Возглавлял военную прокуратуру Главный военный прокурор, который имел двух помощников и непосредственно подчинялся военному министру. Он назначался на должность Высочайшим указом по представлению военного министра. Военные прокуроры со своими помощниками состояли при каждом военно-окружном суде. В ходе этой же реформы существовавший в военном ведомстве Аудиторский департамент был преобразован в Главное военно-судное управление. Его начальником стал В.Д. Философов (1820-1894), назначенный Александром II с 1 сентября 1867 г. Главным военным прокурором.
На основании одного из первых советских законодательных актов, — Декрета "О суде" (1917 г.), — были упразднены существовавшие институты судебных следователей, прокурорского надзора. Этим же декретом были созданы новые, советские суды. В декабре 1921 года принято решение об учреждении в составе Народного комиссариата юстиции Государственной прокуратуры, а в ноябре 1922 года после проведения судебной реформы в целях осуществления надзора за соблюдением законов и в интересах правильной постановки борьбы с преступностью была учреждена Государственная военная прокуратура.
В этот же период сформированы первые восемь военных прокуратур округов. Суровым испытанием для нашей страны явилась Великая Отечественная война (1941-1945 гг.). С первых дней структура органов военной прокуратуры была приведена в соответствии с требованиями действующей армии. Офицеры военных прокуратур осуществляли свою деятельность в боевой обстановке, а при необходимости с оружием в руках сражались с врагом в боевых порядках. На протяжении всей войны военные прокуроры и следователи проявили себя истинными патриотами, высококлассными профессионалами и смелыми офицерами.
С начала Великой отечественной войны работа органов прокуратуры, как военных, так и территориальных, была перестроена на военный лад. Количество военных прокуратур увеличилось. В условиях войны работа военной прокуратуры была многообразной и разносторонней, однако с организационной и функциональной точки зрения она по-прежнему укладывалась в две основные формы: общий надзор за законностью в армии и уголовное преследование преступлений. Не претерпевала какой-либо коренной ломки и структура военной прокуратуры.
В первые дни войны были проведены меры по приближению прокурорских органов к частям, и от системы корпусных в качестве низшего звена пришлось перейти к системе дивизионных прокуратур. Были созданы военные прокуратуры фронтов, которым подчинялись военные прокуратуры армий и соединений (общевойсковых, танковых и воздушных армий, отдельных танковых и механизированных корпусов, кавалерийских корпусов, стрелковых дивизий, артиллерийских дивизий Резерва главного командования, воздушно-десантных бригад и др.).
В оперативном подчинении военных прокуратур фронтов, кроме того, находились военные прокуратуры войск НКВД по охране тыла и фронта, и военные прокуратуры железнодорожных войск фронтов. Действовали также военные прокуратуры фронтов противовоздушной обороны, авиации дальнего действия и др. В тылу возникли военные прокуратуры округов с подчинением им военных прокуратур гарнизонов, запасных стрелковых дивизий и авиационных бригад.
В годы войны надзорная деятельность военных прокуроров носила разносторонний характер. Им приходилось вникать буквально во все стороны жизни армии. В поле зрения прокурорского надзора находились такие важные вопросы, как подвоз продовольствия и боеприпасов, эвакуация раненых и организация питания солдат на передовой линии и на отдыхе, обмундирование солдат и воинская дисциплина; работа госпиталей и обеспечение льгот семьям военнослужащих; охрана военного имущества и возврат промышленности пустой тары, использование боевой техники и воинского транспорта и т.д. Можно без преувеличения сказать, что не было ни одного участка жизни и деятельности армии на фронте и в тылу, куда бы не проникал зоркий глаз военного прокурора.
К числу людей, внесших значительный вклад в развитие органов военной прокуратуры в послевоенный период, безусловно, относится генерал-полковник юстиции Артем Григорьевич Горный, который в 1957 году возглавил Главную военную прокуратуру и руководил ее коллективом на протяжении 29 лет
(1957-1986 гг.). С распадом СССР, в начале 90-х годов прошлого века, органы военной прокуратуры, как и вся страна, переживали непростые времена: трудности в экономике резко осложнили финансирование, вооруженные конфликты в различных регионах, лавинообразный всплеск преступности, многочисленные реорганизации вызвали отток кадров прокуроров и следователей, существенно затрудняли обеспечение законности и правопорядка в войсках.
В настоящее время органы прокуратуры в Российской Федерации составляют единую централизованную систему с подчинением нижестоящих прокуроров вышестоящим и Генеральному прокурору Российской Федерации.
Военная прокуратура Барнаульского гарнизона ведет свою историю с момента издания директивы Главного военного прокурора от 26 января 1943 года № 6/2982 и приказа военного прокурора Сибирского военного округа от 10 февраля 1943 года № 255.
Местом дислокации военной прокуратуры выбран г. Барнаул Алтайского края.
В сентябре 2007 года, на базе бывшей военной прокуратуры Алейского гарнизона образован участок военной прокуратуры Барнаульского гарнизона с местом дислокации в г. Алейске Алтайского края.
Более чем за 78 лет военная прокуратура гарнизона благодаря своим работникам прошла насыщенный достижениями и событиями путь.
Сотрудники военной прокуратуры Барнаульского гарнизона осуществляют надзор и поддерживают правопорядок на территории Алтайского края, тесно сотрудничая с военно-следственным отделом и прокуратурой Алтайского края, расположенными в одном здании. Сегодня полномочия военной прокуратуры Барнаульского гарнизона простираются на территории, площадь которой более ста тысяч квадратных километров. Подразделение обслуживает более ста объектов, где численность военнослужащих и гражданского персонала составляет около семи тысяч человек, при этом более восьмидесяти процентов поднадзорных воинских частей и учреждений находятся за пределами города Барнаула.
Первым прокурором военной прокуратуры Барнаульского гарнизона назначен Янушевский П.А., который находился в данной должности до февраля 1944 года.
В настоящее время должность военного прокурора Барнаульского гарнизона занимает полковник юстиции Русанов Вадим Вячеславович.
Продолжая исполнять возложенные на военную прокуратуру Барнаульского гарнизона законодательством полномочия коллектив прокуратуры в последние годы добился значительных результатов в надзорной работе.