С 1 января 2021 года в российское налоговое законодательство внесены поправки, в соответствии с которыми установленной льготой по НДС (освобождение от уплаты налога в соответствии с подпунктом 26 пункта 2 статьи 149 Налогового кодекса) могут воспользоваться не только правообладатели, но и участники цепочки поставки программного обеспечения.

Воспользоваться льготой могут те организации, у которых компьютерное обеспечение включено в единый реестр российских программ для электронных вычислительных машин и баз данных и не используется клиентом для размещения рекламы и поиска продавцов или покупателей. Кроме того, льгота будет распространяться и на программы, входящие в состав программно-аппаратных комплексов.

Указанное освобождение применяется для операций по реализации исключительных прав или прав использования с момента включения программы для ЭВМ (базы данных) в единый реестр. За периоды использования программ (баз данных) в 2020 году применяется освобождение по НДС, а начиная с 1 января 2021 года за периоды использования указанного программного обеспечения, не включённого в реестр российских программ, применяется налоговая ставка по НДС в размере 20%, независимо от даты заключения договора и порядка оплаты указанных прав. В случае, если оплата за предоставление прав произведена в текущем году за период использования программ до 2021 года, применяется освобождение по НДС, поскольку реализация состоялась в минувшем году.

Для применения пониженной ставки по налогу на прибыль в размере трёх процентов в качестве обязательного условия не установлено российское происхождение программы (пункт 1.15 статьи 284, пункт 5 статьи 427 НК РФ). Организация, занимающаяся адаптацией компьютерных программ, их установкой и сопровождением, при расчёте необходимой доли доходов вправе учитывать доходы от услуг по установке, тестированию и сопровождению только тех программ (баз данных), которые она ранее разрабатывала, модернизировала или адаптировала. Аналогичное правило действует также в отношении страховых взносов.